Интервью и статьи
Применение ускоренного метода идентификации энтеробактерий в бактериологической лаборатории ГУ «РЦГиЭ» города Тирасполь
Г.А. Залецки, заведующая бактериологической лабораторией ГУ РЦГиЭ;
Н.И. Гасан, врач-бактериолог ГУ РЦГиЭ.
Актуальность: Лабораторная диагностика острых кишечных инфекций является первостепенной задачей в процессе выявления этиологии заболеваний кишечника.
При идентификации патогенных и условно-патогенных энтеробактерий изучают их биохимическую активность и серологические свойства, поскольку они положены в основу их классификации и всегда используются для установления родовой принадлежности выделенных возбудителей, а также их видовой и типовой дифференциации. Идентификация энтеробактерий включает 3 этапа: а) первичную идентификацию; б) установление родовой принадлежности; в) идентификацию вида и внутривидовую дифференциацию.
Выполнение первого этапа предусматривает определение биохимических признаков изучаемой культуры с использованием сред для первичной идентификации (комбинированных сред), а при необходимости и тестов для дифференциации энтеробактерий от других грамотрицательных бактерий. На втором этапе применяют тесты минимального дифференцирующего ряда в наборе для установления рода (дифференциация от сходных родов). Третий этап идентификации предполагает использование дополнительных тестов для внутриродовой дифференциации -определение видов, биоваров и сероваров.
На втором и третьем этапах идентификации применяется общепринятый классический метод, при использовании которого на определение ферментативных свойств затрачивается 24-48 и более часов, расходуется много питательных сред и лабораторной посуды.
Для ускоренной диагностики изготовители бакпрепаратов выпускают различные тест-системы, которые позволяют сократить время выдачи результатов до 18-24 часов. В нашей бактериологической лаборатории г. Тирасполь ГУ РЦГиЭ в 2020 году внедрены тест-системы для биохимической идентификации и дифференциации энтеробактерий «ДС-ДИФ - ЭНТЕРО -12», изготовитель ООО «НПО» Россия, г. Нижний Новгород. Для установления родовой и видовой их принадлежности используется каталог, который включает в себя определение 54 видов значимых энтеробактерий, относящихся к 17 родам, по 12 биохимическим признакам.
Предлагаемый метод отличается высокой специфичностью, простотой
исполнения и высокой информативностью.
Материалы и методы. Метод основан на идентификацию до вида по двенадцати биохимическим признакам 24 штаммов микроорганизмов семейства энтеробактерий, выделенных в ходе бактериологического анализа. Для постановки биохимических рядов используются полистироловые микропланшеты 96- луночные разборные однократного применения, на дно лунок которых нанесены индикаторные питательные среды. Стерильный планшет с крышкой в герметической упаковке имеет 24 стрипа (по 12 лунок).
Набор тест-системы для идентификации энтеробактерий включает среды и реактивы, необходимые для учета 12 тестов. Эти тесты разбиты на 4 триады. Каждый тест в триаде кодирован цифрой.
При учете биохимических реакций используются знаки «+» и «-» в зависимости от изменения цвета индикатора применяемых сред. Из суммы цифр со знаком «+» из каждой триады составлены коды для 54 видов энтеробактерий. Коды составлены для следующих родов энтеробактерий: Escherichia, Shigella, Salmonella, Citrobacter, Klebsiella, Enterobacter, Hafnia, Serratia, Edwardsiella, Pantoea, Proteus, Providencia, Morganеlla, Yersinia, Kluyvera, Yokenella. Коды упорядочены по нумерации и сформированы в списки.
Ход исследования. Подлежащую изучению колонию со среды первичного посева для энтеробактерий (Эндо, Плоскирева) пересеваем на среды трехсахарный агар с мочевиной – Олькеницкого и питательный агар для выделения чистой культуры и учета биохимических свойств. Инкубируем при (37±0,5)°С 18-24 часа. Исследования проводим с чистой культурой, после определения принадлежности к семейству энтеробактерий (грамотрицательные палочки, оксидазоотрицательные, утилизирующие глюкозу, подвижные и неподвижные).
В день исследования стерильными пипетками вносим в лунки одного ряда планшета ( стрипы) по 0,1 мл микробной суспензии одной культуры. В одном ряду лунок - среды для одной исследуемой культуры. Планшеты закрываем крышкой и помещаем в пакет. Инкубируем планшет при температуре (37±0,5)°С 18-24 часа. Учет результатов биохимических реакций проводим по изменению цвета индикатора визуально в соответствии с цветовым показателем. При разложении или при отсутствии разложения сред тестам ставим знак «+» или «-». Биохимическую активность Klebsiella pneumoniae отражена в таблице № 2 с последующим определением ее кода:
Таблица № 2.
Биохимическую активность микроорганизма Klebsiella pneumoniae
|
цитрат натрия |
сероводородд |
В-галактозидаза |
фенилаланин |
лизин |
орнитин |
Лизин |
маланат натрия |
мочевина |
сорбит |
инозит |
АМК |
Кодовые цифры |
4 |
2 |
1 |
4 |
2 |
1 |
4 |
2 |
1 |
4 |
2 |
1 |
Результат теста «+»или «-» |
+ |
- |
+ |
- |
+ |
- |
- |
+ |
+ |
+ |
+ |
+ |
Сумма цифр со знаком «+» и код |
5 |
2 |
3 |
7 |
||||||||
Результат: наиме-нование культуры |
Klebsiella pneumoniae |
Окончательная идентификация условно-патогенных энтеробактерий проводится с помощью «кодов» по списку каталога. Дальнейшая идентификация энтеробактерий на серовары проводится с помощью серологических реакций.
Результаты и обсуждение. В 2020 году с июля по сентябрь одновременно двумя методами биохимической идентификации (ускоренным - в планшетах и классическим - в пробирках) было выполнено 50 исследований. В ходе данных исследований идентифицированны следующие представители семейства энтеробактерий которые отражены в таблице № 3 и диаграмме 1:
Таблица № 3
Выделенные микроорганизмы по системе «ДС-ДИФ - ЭНТЕРО -12»
с |
Количество штаммов 2020 г |
Процентное соотношение микроорганизмов |
Патогенные энтеробактерии |
||
Salmonella muenchen |
14 |
28 % |
Salmonella enteritidis |
8 |
16 % |
Salmonella coeln |
1 |
2 % |
Условно-патогенные энтеробактерии |
||
Klebsiella pneumoniae |
7 |
14 % |
Klebsiella oxytoca |
6 |
12 % |
Escherichia coli |
10 |
20 % |
Enterobacter cloacae |
1 |
2 % |
Serratia marcescens |
2 |
4 % |
Citrobacter freundii |
1 |
2 % |
Диаграмма 1
Учет проводился по «коду» и по таблице биохимической идентификации. Конечные результаты во всех 50 случаях идентичны. Ускоренный метод исследования с применением каталога для установления родовой и видовой принадлежности энтеробактерий равнозначен по результатам классическому методу идентификации энтеробактерий.
При постановке каждого биохимического ряда тест - на газообразование глюкозы - учитывали на среде Олькеницкого, а для теста на подвижность использовали 0,3 % полужидкий питательный агар. Для остальных 12-ти тестов были использованы - при ускоренном методе стандартные среды в планшетах завода-изготовителя, в которые вносили по 0,1 мл микробной суспензии одной культуры на 1 лунку планшета, а при классическом методе - по 5,0 мл сред в пробирках, приготовленных в лаборатории. Таким образом, при ускоренном методе идентификации расходуется в 7 раз меньше жидких питательных сред и используются микропланшеты, на которых можно одновременно поставить 24 биохимических ряда и требуется меньше лабораторной посуды и затрат труда.
Предлагаемый микролуночный метод ускоренной биохимической идентификации энтеробактерий позволяет сократить сроки выдачи результатов на 18 часов.
Выводы:
- Тест-системы для биохимической идентификации энтеробактерий и учет результатов по каталогу “кодов” равнозначен по достоверности классическому методу.
- Предложенный способ является более экономичным, поскольку сокращает расход питательных сред, химических реактивов и лабораторной посуды и затраты труда.
- Уменьшает трудоемкость исследований.
- Метод позволяет сократить сроки выдачи результатов на 18 часов.
Литература:
- Методические указания по микробиологической диагностике заболеваний, вызываемых энтеробактериями. - Тирасполь: М3 и СЗ Г1МР, 2003.
- Поздеев О.К. Медицинская микробиология / Под ред. Акад. РАМН В.И. Покровского. - М.: ГЭОТАР-МЕД, 2001. - 768 с.: ил. - (XXI век).
- Воробьев А.А., Кривошеин Ю.С., Широбоков В.П. Медицинская и санитарная микробиология. - Москва, Academia, 2003.